电梯机房设在楼顶，是现代高层建筑设计中常见的一种做法。然而，这种设计在实际应用中往往会引发一些争议，尤其是当物业或邻居对这一安排提出质疑时。那么，物业是否真的会因此不让设置，或者邻居是否会对此有意见？这需要从多个角度进行分析。

首先，从法律法规的角度来看，电梯机房的设置必须符合国家和地方的相关建筑规范。例如，《电梯制造与安装安全规范》（GB 7588）明确规定了电梯设备的安装位置、结构要求以及安全距离等。如果机房的位置符合这些规定，那么从法律层面来说，物业是没有权利单方面阻止其设置的。当然，如果在施工过程中存在违规行为，比如未取得相关审批或违反规划，那么物业或相关部门有权介入并提出异议。

其次，从物业管理的角度来看，物业公司的职责主要是维护小区的整体环境和公共秩序。如果机房设置在楼顶，可能会对楼体结构、防水系统、通风条件等产生影响，从而增加维护成本。此外，如果机房噪音较大，可能会影响到楼上住户的生活质量。因此，物业公司通常会从管理角度出发，提出合理的建议或限制，以确保整个小区的和谐与安全。

再者，邻居的意见也不可忽视。虽然机房本身并不直接占用居民的私人空间，但如果机房的设计不合理，例如通风不良、噪音大、存在安全隐患等，就可能引起邻里的不满。特别是对于住在顶层的住户来说，他们更可能感受到机房带来的影响。在这种情况下，邻里之间的矛盾可能会逐渐升级，甚至影响到小区的和谐氛围。

为了避免这些问题，开发商和物业公司在设计阶段就需要充分沟通，提前征求业主和邻居的意见。同时，可以采用一些技术手段来减少机房对周边的影响，例如使用隔音材料、优化通风系统、定期进行安全检查等。此外，还可以通过设立专项基金或补贴方式，为受影响的住户提供一定的补偿或改善措施。

最后，值得注意的是，随着科技的发展，一些新型电梯技术已经能够减少对传统机房的依赖。例如，无机房电梯和永磁同步曳引机等技术的应用，使得电梯的运行更加高效，同时也减少了对楼顶空间的需求。这类技术的推广，或许能有效缓解因机房设置而引发的争议。

总之，电梯机房设在楼顶是否会被物业或邻居反对，取决于多种因素，包括法律法规、设计合理性、管理规范以及技术进步等。只有在多方协调、科学规划的前提下，才能实现电梯功能与居住环境的平衡发展。